永代供養にすると、お骨はごちゃまぜにされてしまうの？

利用される永代供養のお墓によって、おっしゃるとおり「ごちゃまぜ」になる場合があります。

むしろ広く浸透している永代供養としては、最初から「ごちゃまぜ」となるか、いずれかのタイミングで「ごちゃまぜ」になるスタイルです。

永代供養のスタイルには、主に下記の3つがあります。

1.　最初から合祀するスタイル

2.　一定期間は個別に埋蔵され、一定期間経過後に合祀するスタイル

3.　半永久的に個別に埋蔵するスタイル

「合祀（ごうし）」とは、ひとつの埋蔵庫（埋蔵スペース）に他の方の御遺骨とまとめて埋蔵することを言います。
他の方の御遺骨と混じり合う（「ごちゃまぜ」）ことになります。

2の一定期間とは利用するお墓によって個々に定められていて、たとえば３年、５年、10年、33年、50年など期間は様々です。

一般的に個別に埋蔵される期間が長いほど料金は高くなります。

永代供養と言いますと、1または2のスタイルが多く見られます。